인프피지만 갓생살아요

단백질을 잘 키워준 대장균님 고마워요. 수고하셨으니 이제 세포벽을 허물고 내부의 단백질을 용액 상태로 추출해서 자유를 드릴게요.[1] 세포 파쇄하기1. 준비물① 냉동된 Cell Pellet in microtube② 냉동된 Lysozyme 200 µl③ 실온 보관된 Lysis Buffer(pH 8.0) 10ml④ ice bucket (세포파쇄기에 들어갈 작은 크기로, 얼음 가득, 물 뿌려서 준비)Sonication 시 열이 많이 발생하므로 아이스버킷에 물을 섞어 냉각 효율을 높이는 것이 단백질 구조 유지에 결정적.온도 제어는 실험 성공을 위한 핵심 포인트! 단백질 변성 방지를 위해 아이스버킷에 물을 채워 밀착 고정한다.buffer는 항상 차갑게! 프로틴은 항상 찬 게 좋다. 2. 재현탁 (Resuspens..

규쁘삐 학생어제 논의에 이어서 본인이 좀 더 해 볼 수 있는 연구 주제를 주고자 하네. 첨부한 manuscript은 특정 조건에서 (암 조직 환경) 항원 결합력이 생기는 activatable antibody 개발에 관한 것이네. 이를 위해서는 항체 (항체조각)의 CDR 부위를 masking하고 암 조직 환경에서 이 mask가 효과적으로 분리되는 것이 필요하네.①이 manuscript에서는 anti-HER2 scFv의 CDR를 mask하기 위해 이에 대한 single domain antibody를 사용했는데② 좀 더 일반적인 연구를 위해서는 우리가 관심있는 항체 (혹은 항체조각)를 mask할 수 있는 단백질 설계가 중요하네.③규쁘삐 학생이 anti-HER2 scFv의 CDR를 효율적으로 mask할 수 있는..

PAGE란?1차적으로 target protein의 크기를 확인하는 과정이다. * SDS (Sodium Dodecyl Sulfate) *- 음이온성 계면활성제(Detergent).- 단백질의 소수성(hydrophobic) 영역에 결합해 입체 구조를 파괴하고 긴 사슬로 푼다.- 단백질 고유의 전하를 없애고, SDS가 붙어 크기에 비례하는 강한 음전하를 띠게 한다.- 결과적으로 단백질이 오직 분자량(질량)에 의해서만 이동하게 만든다.[1] Loading Sample 만들기1. Protein Dye 재료 배합① 5X Loading dye 180λ + DTT(10X) 20λ를 섞어 총 200λ mixture를 만든다.DTT 역할 (Dithiothreitol): S-S bond(이황화 결합)를 절단하여 단백질의 ..

사수님 논문을 공부해보았습니다.번역기 도움 없이 쭉 읽어보았어요!!!Pro-infliximab maintained normal pharmacokinetics and biodistribution, 전까지 정리했고 중간고사 이슈로 아직 공부중입니다...먼저 알고 갈 내용Thesis : ApoF(비천연 아미노산)를 이용한 광학적 제어와 MMP(기질 금속 단백질 분해 효소)를 이용한 종양 타겟팅MMP (Matrix Metalloproteinase): TME나 염증 부위에 많이 존재하는 Endopeptidase(Zn2+ 이온 함유) 계열의 프로테아제(단백질 분해 효소). ECM의 단백질 성분을 분해합니다. 암 연구 및 항체 치료제 설계에서 항체의 활성을 막는 '마스크'를 끊어주는 트리거(Trigger) 역할을 합..

오늘로서 FPEL에 5일차 출근을 했습니다.지금까지 단백질 연구를 위한 실험 기법 네 개를 배웠고, 사수님께서 최근 쓰신 논문을 공부했고, 랩미팅도 한 번 참여했어요!! Com Cell 은 Competent Cell의 줄임말,람다(λ)는 표준 단위인 μℓ (microliter)의 현장 용어입니다.OD600 값은 600nm 파장의 빛을 배양액에 쏘았을 때, 얼마나 많은 빛이 세포에 가로막혀 흡수되거나 산란되는지를 측정하는 것입니다. 간단히 말해 "우리 배양액 안에 세포(세균)가 얼마나 빽빽하게 들어있는지"를 숫자로 나타낸 지표입니다.2xYT는 미생물(주로 E. coli)을 아주 배불리 먹여서 고농도로 키울 때 사용하는 영양 만점 배지입니다.[1] E.coli Transformation (대장균이 단백질을 ..