인프피지만 갓생살아요

단백질을 잘 키워준 대장균님 고마워요. 수고하셨으니 이제 세포벽을 허물고 내부의 단백질을 용액 상태로 추출해서 자유를 드릴게요.[1] 세포 파쇄하기1. 준비물① 냉동된 Cell Pellet in microtube② 냉동된 Lysozyme 200 µl③ 실온 보관된 Lysis Buffer(pH 8.0) 10ml④ ice bucket (세포파쇄기에 들어갈 작은 크기로, 얼음 가득, 물 뿌려서 준비)Sonication 시 열이 많이 발생하므로 아이스버킷에 물을 섞어 냉각 효율을 높이는 것이 단백질 구조 유지에 결정적.온도 제어는 실험 성공을 위한 핵심 포인트! 단백질 변성 방지를 위해 아이스버킷에 물을 채워 밀착 고정한다.buffer는 항상 차갑게! 프로틴은 항상 찬 게 좋다. 2. 재현탁 (Resuspens..

규쁘삐 학생어제 논의에 이어서 본인이 좀 더 해 볼 수 있는 연구 주제를 주고자 하네. 첨부한 manuscript은 특정 조건에서 (암 조직 환경) 항원 결합력이 생기는 activatable antibody 개발에 관한 것이네. 이를 위해서는 항체 (항체조각)의 CDR 부위를 masking하고 암 조직 환경에서 이 mask가 효과적으로 분리되는 것이 필요하네.①이 manuscript에서는 anti-HER2 scFv의 CDR를 mask하기 위해 이에 대한 single domain antibody를 사용했는데② 좀 더 일반적인 연구를 위해서는 우리가 관심있는 항체 (혹은 항체조각)를 mask할 수 있는 단백질 설계가 중요하네.③규쁘삐 학생이 anti-HER2 scFv의 CDR를 효율적으로 mask할 수 있는..

외장하드는 공장에서 나올 때 보통 NTFS라는 '윈도우 전용 언어'로 설정되어 나옵니다.맥북은 이 언어를 '읽을 수는 있지만, 쓸 수는 없는(파일을 넣거나 수정할 수 없는)' 상태로 취급합니다.그래서 맥북이 이해할 수 있는 언어(포맷)로 번역(변환)해주는 'Erase(지우기)' 과정을 거쳐맥북이 외장하드를 사용할 수 있는 상태로 만드는 과정이 필요합니다. 1. command + space 눌러서 검색창에 disc utility를 검색해서 찾아준다. 2. SAMSUNG 이라고 되어있는 애를 찾아서 클릭한다.3. 상단의 Erase 버튼을 눌러서 Name을 설정해주고 Format을 MacOS Extended (Journaled)로 설정해주면 끝.MacOS Extended: 맥 전용 (맥에서 제일 안정적)eX..

https://dacon.io/competitions/official/236518/codeshare/12626신약보단마약이지 님의 코드를 분석해보았어요 1. 라이브러리 및 데이터 로드먼저 쓸 도구들을 가져오는 단계.import pandas as pdimport subprocessimport lightgbm as lgbimport numpy as npfrom rdkit import Chemfrom rdkit.Chem import AllChemfrom tqdm import tqdmimport os * pandas, numpy는 데이터 다루는 기본 도구, lightgbm은 머신러닝.신약 개발 핵심 도구인 rdkit -> 화합물 구조를 다루기 위해 사용.subprocess는 파이썬 안에서 터미널(명령 프롬프..

PAGE란?1차적으로 target protein의 크기를 확인하는 과정이다. * SDS (Sodium Dodecyl Sulfate) *- 음이온성 계면활성제(Detergent).- 단백질의 소수성(hydrophobic) 영역에 결합해 입체 구조를 파괴하고 긴 사슬로 푼다.- 단백질 고유의 전하를 없애고, SDS가 붙어 크기에 비례하는 강한 음전하를 띠게 한다.- 결과적으로 단백질이 오직 분자량(질량)에 의해서만 이동하게 만든다.[1] Loading Sample 만들기1. Protein Dye 재료 배합① 5X Loading dye 180λ + DTT(10X) 20λ를 섞어 총 200λ mixture를 만든다.DTT 역할 (Dithiothreitol): S-S bond(이황화 결합)를 절단하여 단백질의 ..

강연자 : KRICT 김민희 선배님! 지난 5월 8일, GIST 대학 C동에서 진행된 졸업생 초청 강연 내용을 정리해보려 한다.이번 강연자는 GIST 화학과에서 학·석·박사를 마치신 김민희 선배님으로,현재 한국화학연구원(KRICT) GCT(유전자·세포치료) 전문연구단에서 선임연구원으로 계신다.특히 이번 강연은 화학 전공뿐만 아니라 생명과학과 사람들과의 협업이 어떻게 이루어지는지,그리고 정출연 인턴십의 실무적인 환경이 어떤지를 엿볼 수 있어 매우 유익했다. 1. 선배님이 계신 GCT 전문연구단은 어떤 곳?GCT(Gene & Cell Therapy, 유전자 세포치료) 전문연구단은 융합 연구가 활발히 일어나는 곳이다. 선배님은 화학 전공이시지만, 실제 연구 현장에서는 생명과학 전공자들과도 함께 팀을 이루어 업..

1. merely 단지 (simply, only, no more than, just, purely) 다른 특별한 의도나 복잡한 조건 없이 오직 그것뿐인 상태. 예문The man merely wanted to buy a bottle of water, but the store was already closed.👉 mere (단순한) + -ly (부사형) = 오직 그것뿐인 2. decimate (DES-uh-meyt)(많은 사람을) 죽이다 (destroy, eliminate, wipe out, demolish, devastate) 전쟁이나 전염병 등으로 인해 집단의 수를 엄청나게 줄여버리는 참혹한 행위. 예문The Black Plague decimated the population in Europe.👉 d..

사수님 논문을 공부해보았습니다.번역기 도움 없이 쭉 읽어보았어요!!!Pro-infliximab maintained normal pharmacokinetics and biodistribution, 전까지 정리했고 중간고사 이슈로 아직 공부중입니다...먼저 알고 갈 내용Thesis : ApoF(비천연 아미노산)를 이용한 광학적 제어와 MMP(기질 금속 단백질 분해 효소)를 이용한 종양 타겟팅MMP (Matrix Metalloproteinase): TME나 염증 부위에 많이 존재하는 Endopeptidase(Zn2+ 이온 함유) 계열의 프로테아제(단백질 분해 효소). ECM의 단백질 성분을 분해합니다. 암 연구 및 항체 치료제 설계에서 항체의 활성을 막는 '마스크'를 끊어주는 트리거(Trigger) 역할을 합..

1. duration 지속되는 기간 (span, length, term) 어떤 일이나 현상이 시작되어 끝날 때까지 걸리는 시간의 폭. 예문Napoleon lived on the island of Elba for the duration of one year.[cite: 4]👉 dur (오래 견디다) + -ation (상태) = 견디며 지속되는 시간 2. massive 대규모의, 거대한 (huge, enormous, very large, tremendous, colossal) 부피가 매우 크고 무게감이 느껴질 정도로 엄청난 규모인 상태. 예문The company's refusal to raise wages resulted in a massive strike.[cite: 4]👉 mass (덩어리) + -i..